За победу на городском этапе боролись 11 лидирующих команд юношей и девушек образовательных организаций от каждого административного округа. В составе каждой команды было по 20 пловцов: поровну юношей и девушек. Соревнования проводились отдельно для юношей и девушек. В эстафетных заплывах каждый участник на время преодолевал водную дистанцию 4х50 метров. Победителей определили по общему времени, затраченному пловцами команды от старта до финиша эстафеты.

Самыми быстрыми среди юношей стали пловцы школы №171, а среди девушек – спортсменки из лицея №1557 Зеленограда. Вторые результаты среди команд юношей и девушек показали юные пловцы из школы №2127. Почетное третье место завоевали юноши из зеленоградского лицея №1557 и девушки из школы №1944.

В программу Президентских спортивных игр помимо соревнований по плаванию входят соревнования по легкой атлетике, шашкам, настольному теннису и уличному баскетболу. Победитель и призеры Президентских спортивных игр 2016-2017 учебного года среди столичных школьных команд определятся по итогам их участия во всех 5 видах соревнований в конце учебного года.